Sejak Emis 4.0 Kemenag diluncurkan pada bulan April 2021, fitur untuk hapus siswa memang belum tersedia, sehingga untuk menghilangkan siswa yang tidak aktif di Madrasah dapat menggunakan fitur non aktif-kan siswa.Dalam pendataan Emis 4.0 semester genap tahun pelajaran 2021, fitur-fitur emis 4.0 yang dapat digunakan oleh pengelola lembaga (operator madrasah) untuk melakukan pengecekan & merubah